La IEP La Recoleta fue creada por los religiosos Franciscanos del Convento de La Recoleta, pertenecientes a la Provincia Misionera de San Francisco Solano del Perú, en su deseo de apoyar a la comunidad arequipeña con una obra de proyección social hacia los más necesitados. Es así que los hermanos franciscanos Fray Ismael Manero y Fray Carlos La Fuente gestionaron su creación mediante la R.D. N° 5159 del 29 de diciembre de 1966. El 24 de Junio de 1983 se oficializó el nombre y en el año de 1989 se amplió el servicio educativo para el nivel secundario con R.D. N° 01175-1989. En el año 2002 el colegio empezó a albergar a niños y jóvenes de ambos sexos y en el año 2017 se implementó el nivel Inicial con Doc: 790394, Exp. 534716 – 2017.

Durante todos estos años de servicio educativo, desde su creación hasta la actualidad, la Institución se ha ido fortaleciendo y ha asumido los retos que demanda la sociedad.